Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
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