Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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