Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms