Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms