Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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