Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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