Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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