Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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PTPRMP28827 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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PTPRMP28827 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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PTPRMP28827 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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PTPRMP28827 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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PTPRMP28827 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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PTPRMP28827 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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PTPRMP28827 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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PTPRMP28827 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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PTPRMP28827 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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