Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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PTPRAP18433 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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PTPRAP18433 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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PTPRAP18433 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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PTPRAP18433 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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PTPRAP18433 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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PTPRAP18433 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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PTPRAP18433 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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