Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CEP290O15078 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CEP290O15078 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CEP290O15078 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CEP290O15078 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CEP290O15078 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CEP290O15078 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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CEP290O15078 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CEP290O15078 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CEP290O15078 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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CEP290O15078 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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CEP290O15078 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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CEP290O15078 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CEP290O15078 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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CEP290O15078 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CEP290O15078 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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CEP290O15078 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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CEP290O15078 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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CEP290O15078 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CEP290O15078 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CEP290O15078 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CEP290O15078 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CEP290O15078 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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