Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms