Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms