Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms