Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms