Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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TCOF1Q13428 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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TCOF1Q13428 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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TCOF1Q13428 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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TCOF1Q13428 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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TCOF1Q13428 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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TCOF1Q13428 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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TCOF1Q13428 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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TCOF1Q13428 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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