Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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SGCGQ13326 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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