Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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CASQ1P31415 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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CASQ1P31415 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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CASQ1P31415 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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CASQ1P31415 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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CASQ1P31415 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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CASQ1P31415 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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CASQ1P31415 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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CASQ1P31415 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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CASQ1P31415 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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CASQ1P31415 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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CASQ1P31415 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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CASQ1P31415 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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