Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
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HOXD10P28358 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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HOXD10P28358 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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HOXD10P28358 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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HOXD10P28358 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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HOXD10P28358 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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HOXD10P28358 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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HOXD10P28358 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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