Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 ERG-210ENST00000442448 5034 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 SCYL2-211ENST00000635101 3948 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 RPA1-201ENST00000254719 4340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 ZBTB40-201ENST00000374651 8368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 MOBP-201ENST00000311042 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 TIAM2-208ENST00000461783 6981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 RAB21-201ENST00000261263 15546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 FRRS1-201ENST00000287474 2678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 MYH2-206ENST00000622564 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 NPIPB11-201ENST00000524087 3653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 MS4A7-202ENST00000358246 2871 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 ERMAP-202ENST00000372514 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 C4orf46-202ENST00000508457 3358 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 ZNF583-202ENST00000333201 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 SP140-203ENST00000392045 3246 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 AL049733.1-201ENST00000440178 603 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC069499.2-201ENST00000610665 382 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC026336.5-201ENST00000624455 738 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 ZNF30-204ENST00000601142 2280 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 CNTNAP4-201ENST00000307431 4867 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 CNTNAP4-207ENST00000611870 4867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 SERPINA1-201ENST00000355814 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 SORBS1-212ENST00000371249 5927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 TMEM182-203ENST00000412401 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRHP20396 PAX6-270ENST00000640368 6975 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 LACTB2-AS1-201ENST00000499227 3716 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 TTC21A-205ENST00000440121 3941 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 NOP14-AS1-207ENST00000515194 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 BMS1P2-202ENST00000532854 1858 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 TXLNG-201ENST00000380122 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 DNM1L-207ENST00000452533 4439 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms