Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms