Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 OR52D1-201ENST00000322641 1065 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
DTX3Q8N9I9 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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