Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RPL17P1-201ENST00000445304 536 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL109933.1-201ENST00000448126 292 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 784 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LINC00572-201ENST00000450264 575 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL360181.1-201ENST00000452591 184 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RPS27P12-201ENST00000464146 258 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RN7SL751P-201ENST00000473281 284 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL133368.1-201ENST00000486273 814 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MYL5-205ENST00000505477 584 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LEF1-AS1-205ENST00000508286 444 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SNCA-211ENST00000508895 905 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AF121898.1-203ENST00000518494 826 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LINC01499-201ENST00000528720 553 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 PRR13-204ENST00000547368 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC126177.6-201ENST00000550420 1009 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 OVCH1-AS1-202ENST00000550906 654 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 GOLGA6L5P-203ENST00000559768 578 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RN7SL509P-201ENST00000579670 297 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC080112.1-201ENST00000583752 487 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL365214.3-204ENST00000587816 894 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SLFN5-203ENST00000592325 1225 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ADAL-208ENST00000610420 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SNCA-212ENST00000611107 297 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.82-201ENST00000611637 265 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC009237.16-201ENST00000612987 506 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL627230.8-201ENST00000613335 202 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MIR6505-201ENST00000617206 71 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 CCL14-202ENST00000618404 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 CR392039.3-201ENST00000623236 227 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC005703.5-201ENST00000623654 555 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LINC02034-201ENST00000635368 760 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ERV3-1-201ENST00000394323 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LGSN-201ENST00000370657 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 GLRA3-202ENST00000340217 3065 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SLC2A11-205ENST00000403208 564 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms