Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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