Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MIR4262-201ENST00000578394 54 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL359475.1-201ENST00000414505 292 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 GRPEL2P2-201ENST00000421856 670 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 OR52U1P-201ENST00000439752 923 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 FAM177B-204ENST00000445590 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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VAMP3Q15836 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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