Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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