Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
COL4A6Q14031 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms