Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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