Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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TRAF1Q13077 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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TRAF1Q13077 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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TRAF1Q13077 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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TRAF1Q13077 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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TRAF1Q13077 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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TRAF1Q13077 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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