Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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PTPRAP18433 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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PTPRAP18433 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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PTPRAP18433 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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PTPRAP18433 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
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PTPRAP18433 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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PTPRAP18433 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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PTPRAP18433 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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