Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms