Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LRRTM2O43300 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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