Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms