Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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CCDC142Q17RM4 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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CCDC142Q17RM4 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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CCDC142Q17RM4 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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CCDC142Q17RM4 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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CCDC142Q17RM4 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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CCDC142Q17RM4 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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CCDC142Q17RM4 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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CCDC142Q17RM4 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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