Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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