Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 TMEM196-205ENST00000493519 687 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC114956.3-202ENST00000505645 482 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RN7SL311P-201ENST00000579858 306 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ZNF473-209ENST00000601364 603 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC013489.3-201ENST00000623274 517 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RNA5SP301-201ENST00000362537 121 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 SNORA11D-201ENST00000408548 128 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC02470-201ENST00000412084 979 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC01353-201ENST00000412772 775 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL513164.1-201ENST00000423268 311 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 HLTF-AS1-201ENST00000492461 415 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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