Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms