Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms