Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms