Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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