Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 CTNND1-202ENST00000361332 6295 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 BCLAF3-203ENST00000379687 6528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 CTNND1-213ENST00000526357 5994 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LIPG-201ENST00000261292 10441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 URB1-201ENST00000382751 10832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ZNF555-201ENST00000334241 8557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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