Protein–RNA interactions for Protein: D6R9N7

USP17L18, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L18D6R9N7 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
USP17L18D6R9N7 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms