Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms