Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms