Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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DTX3Q8N9I9 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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DTX3Q8N9I9 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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DTX3Q8N9I9 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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DTX3Q8N9I9 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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DTX3Q8N9I9 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DTX3Q8N9I9 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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