Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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PUM3Q15397 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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PUM3Q15397 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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PUM3Q15397 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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PUM3Q15397 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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PUM3Q15397 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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