Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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