Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CDH18Q13634 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CDH18Q13634 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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CDH18Q13634 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CDH18Q13634 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CDH18Q13634 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CDH18Q13634 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CDH18Q13634 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CDH18Q13634 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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