Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms