Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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FOXF2Q12947 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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