Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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FOXO1Q12778 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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FOXO1Q12778 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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FOXO1Q12778 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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FOXO1Q12778 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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